也许在别人看来，让金针菇与黑头病永远说再见是件很难的事，其实只要是用心的做好以下几点要求，这是不难的，首先要保持菇场清洁卫生，及时病菇和废料；菇房、床架、用具等用前要用1：50倍的金星消毒液或2%的漂白粉等消毒，尤其是原发病害较重的菇棚。
拌料时应将疣霉净按1：1000倍比例兑水拌料，不可用高毒、高残留的防污剂之类，以确保生产效果； 金针菇栽培时培养料应，蘑菇和平菇栽培时培养料应充分发酵，腐熟均匀，覆土材料用甲醛熏蒸消毒即可。
金针菇出菇期控制出菇室温度在15°以下，避开高温、高湿季节出菇，高温时加强通风散热，平菇出菇期温度不要超过18°，如果气温突然升高，要采取降温措施，如开窗、揭膜、遮阴等，但要注意菇房内温度波动不能过大，防止水汽凝结，产生水膜。
发现病菇要及时择除，并立即加大通风量，暂停或减少喷水，迅速降低温度，并用药控制病害程度，如可向料面喷洒5%的石灰水清液，也可喷洒每毫升100-200单位的链霉素液或300单位的土霉素，或500-1000倍的漂白粉液，每2天1次，施药前后菇床停水1天，间隔3-4天再次用药，连续用3次以上，能有效控制病害蔓延。发病严重时，应先病菇，清理料面或覆土后再按上述方法喷药。