穗颈瘟主要危害水稻的穗颈、穗轴、枝梗和谷粒，在穗颈、穗轴上产生褐色腐烂斑，可造成空秕粒增多，千粒重下降，对水稻产量和品质影响很大。眼下正值高温多雨季节，因此，生产应注意加强防治。下面介绍其主要症状、发生特点和防治方法。
主要症状：穗颈瘟主要发生在水稻穗颈和枝梗基部，产生褐色小斑点，病斑经过扩展蔓延后环绕穗颈和枝梗，并分别向上下发展，病部呈褐色或墨绿色。在潮湿条件下，病斑上也能产生灰绿色霉层。穗颈瘟如发生早会形成秕谷和白穗，发病晚谷粒会不饱满。
发病特点：稻瘟病在水稻苗期、移栽后的分蘖期和抽穗期侵染，形成苗瘟、叶瘟和穗颈瘟。其中穗颈瘟对水稻影响大，危害主穗梗至枝梗分枝的穗颈部及穗轴、枝梗，使产量和品质下降。穗颈瘟的发生，除了与品种有一定关系外，主要决定因素还是抽穗扬花期的天气情况，抽穗期（8月中下旬）阴雨连绵、气温低，易流行。为此，水稻抽穗扬花期后，阴雨连绵，日照不足或时晴时雨，或早晚有云雾或结露条件，特别是在菌源充足丘块，病情扩展迅速。穗期以始穗时抗病性弱，偏施过施氮肥有利于发病，应谨防穗颈瘟的大发生。
防治方法：对水稻穗颈瘟要采取综合措施加防治。一要选用适合当地栽培的抗病稻瘟病品种；二要合理施肥，增施有机肥、磷钾肥；三要注意合理灌溉，做到薄水插田，深水回青，浅水分蘖，够苗晒田，孕穗、抽穗至黄熟期湿润灌溉的排灌方式，避免深水漫灌；四要做好药剂防治。首先要在始穗前20天撒施8%噻菌灵颗粒剂每亩2公斤拌细砂撒施，用于防治。其次，在破口期、齐穗期各用药一次。另外防治穗颈瘟药剂还有春日霉素，适乐时，灭稻瘟等。在施药时，要注意药剂的交替使用，并讲究施药质量，喷雾要均匀周到，防止漏喷。