培育香菇过程中，为有效防治病虫害及杂菌，我们可以采取如下措施：
1、严格把好关：
在常压下应该使灶内的气温稳定在100摄氏度，并且持续约8个小时；在锅内菌袋排放时，中间应该保留有空隙，致使蒸气保持畅流菌袋受热均匀；要防止因为补水或是烧火等因素造成的中途降温；从拌料到一定要在8小时之内完成，从开始到灶温上升到100摄氏度时不可以超过5小时，以避免料发酵变质。
2、保持好环境卫生：
净化空气能够使空气里的杂菌孢子的密度下降得，是降低杂菌污染积极有效的一种方法。装瓶消毒冷却，接种以及培养室等场所，都要做好平常的清洁卫生。在暴雨之后应该进行集中打扫。坚持每天在空中、地面使用零点二的肥皂水或是三到四的石碳酸水溶液，五的甲醛1：500倍五十的多菌灵水溶液以及五到二十的石灰清水等交叉喷雾或是喷洒，把废弃物以及污染物不失时机的给其烧毁或是浸入到药水缸，以避免污染环境及空气。
3、科学安排接种季节：
一定要按照香菇菌丝生长以及子实体发生对气温的要求，科学合理的安排接种季节。太早接种或是遇夏秋高温气候，不仅明显的增加污染率，并且对菌丝生长发育又非常不利；太迟接种，污染率虽然比较低，但是秋菇的生长期缩短，影响香菇的产量。接种在日平均温度稳定在25摄氏度左右时为效果。夏季温度怒偏高时，接种时间应该安排在午夜到第二日的清晨。
4、减少菌丝：
还没有愈合时产生霉菌，采取把门窗关闭好，定量开窗通风几次，将覆盖的薄膜揭除去，等到控制霉菌之后再覆盖上的措施。若是个别的栽培块产生霉菌，不要急于处理，要等到菌丝愈合之后再作处理，但是需要提高掀动薄膜的次数，并且加强栽培室里的通风换气以及降温减湿。
5、袋料栽培：
危害袋料栽培香菇的主要害虫为螨类及线虫。在菌筒室内培养期间通常是螨的危害，到后期主要是线虫。在培养室或是栽培场产生害虫危害可以喷施高效低毒农药。