在栽培哈密瓜中经常可以见到的病害有猝倒病、枯萎病、白粉病以及霜霉病等等病害。其中，白粉病是为哈密瓜主要的病害，分布广泛，发生普遍，在保护地、露地都有所产生，对哈密瓜产量以及品质造成严重的影响。
在哈密瓜的整个生育期都有可能出现，此病害可以侵染叶片、叶柄以及茎蔓。在发病初期将会在叶面上产生白色小粉斑，多个病斑连成大小不规则的斑点，之后致使叶面布满白粉，就是病菌分生孢子梗和分生孢子。随着病害的不断发展，病叶慢慢出现衰老枯死，有的时候可以在坏死的病斑上出现黑色小点，也就是病菌子囊壳。叶柄以及茎蔓感染病害，在表面也将会出现白色粉状霉斑，在病情严重时病斑密布，组织提早衰退，死亡。
病原菌将会随着病残体在保护地内过冬，也可分生孢子在其他的寄主上危害越冬，通过气流、雨水传播蔓延。此病菌比较喜温湿环境，耐干燥，高温干燥以及潮湿交替对病害的发展非常有利。适宜病原菌成长的气温是为10摄氏度到30摄氏度之间，适宜气温是为20摄氏度到25摄氏度，相对湿度在二十五到八十五分生孢子都能够萌发，以高湿条件适宜出现此病。在生长中后期作物生长衰弱，发病严重。
防治措施
1、根据不同地区选育和种植抗病能力强的品种。
2、加强栽培管理。
利用高畦栽培，科学密植，注意保持通风透气；合理施肥，在定植时施用足够的底肥，增加施用磷、钾肥，防止后期脱肥，培育健壮幼苗；适时进行灌溉，注意排灌结合，避免田间湿度太大；不失时机整枝打叉，发现病株立即将其拔除。
3、农药防治。
在保护地建议使用硫磺熏蒸器定期熏蒸。
在产生病害初期选择使用二的农抗120水剂，或是二的武夷菌素水剂200-300倍液，或是四十三的菌力克悬浮剂8000倍液，或十的世高水分散粒剂8000倍液，或是三十的特富灵可湿性粉剂4000倍液，或是二十五的粉锈宁可湿性粉剂1000-1500倍液喷雾。