晚稻施肥关系到晚稻的产量质量问题，要特别注意。在晚稻生产过程中，有双季晚稻和单季晚稻两种类型，这两种晚稻的生育期和营养需求各不相同，因此晚稻施肥，尤其氮肥的施用时是有明显区别的。
双季晚稻施肥要注意适当增加穗肥，可在幼穗分化期分两次进行。但注意在长江中下游地区，花期施氮肥要控制分次进行，因为后期气温下降较快，过多的氮肥既会引起水稻贪青，推迟成熟减产，也会加重稻株病虫害的发生。根据这些特点，双季晚稻氮肥施用技术上采用基肥与追肥的比例各半的分配原则，穗分化期适量分次施用追肥，在齐穗的条件下，后期看苗补施粒肥，可望获得较好的增产效果。
单季晚稻的吸肥有两个高峰期，一个出现在分蘖期，另一个出现在幼穗分化期，并且后期吸肥高峰比前期高，因此单季晚稻施肥中的穗肥更重要。另外要注意氮肥的施用，氮肥施用分配要体现前稳、中攻、后补的原则，前期适当控制，重点攻大穗，追肥可分两到三次进行，高产条件下，后期加一次粒肥。
晚稻施肥过程中，钾肥施用也很重要，晚稻田比早稻田更容易出现缺钾现象，晚稻施用钾肥对于稻株健康生长和后期抗稻瘟病都很必要，施钾有利于增加晚稻的穗数、穗粒数和终提高产量。一般每亩施钾量以四到六公斤氧化钾为宜，钾肥具体施肥量的多少要根据目标产量及稻田实际苗期来决定。施用时可以一次作基肥，也可以50%作基肥和50%作蘖肥，施用效果更佳。