由于棉花的生育期较长，为了保证棉花全生育期对养分的需求，一定要施足基肥。基肥应以有机肥料为主，配施适量性化肥，棉田常用有机肥以厩肥和堆沤肥为主。有机肥的用量与土壤肥力、肥料质量和产量等因素有关。土壤肥沃，肥料优质者少施，反之多施。北方棉田施用有机肥15吨/公顷或绿肥11.25—-22.5吨/公顷，有条件的地方再加施饼肥750—1125千克/公顷。低产棉田，可通过施用化肥促有机肥，达到培肥土壤的目的。一般在施总氮112.5-150千克/公顷的前提下，以纯氮37.5千克/公顷作基肥（其余的75一112.5千克/公顷花铃期作追肥），与有机肥混合撒施后深耕翻，肥效良好。中上等地力的壤质土壤，蓄肥供肥能力强，氮肥以分两次施用为好，即基肥45%，花铃期追肥55%。土壤肥力较差，质地偏砂，保肥能力低的棉田，氮肥可分三次施用，即基肥30%，蕾期追肥20%，花铃期追肥50%。对于新疆内陆棉区和降雨较少以灌溉为主的旱地棉田，为了降低施肥的劳动投入，将化肥全部作基肥施用效果更好。
磷、钾肥作基肥的用量依据土壤中磷和钾含量的高低，同时还需要考虑土壤保蓄肥的能力。保蓄肥能力较强而质地相对赫重的土壤，磷、钾肥可以全部作基肥；保蓄肥能力较弱的砂壤质土或砂质土壤也可留一部分钾肥作追肥。由于棉花为直根系，入土较深，施用基肥时应注意适度深施。磷肥作基肥全层施用或与农家肥混合堆沤后全层撒施为好。一般每公顷施过磷酸钙600—750千克（P20575一105千克）。在基肥用量较少时，为提高磷、钾肥的效果，可在种植行的行下条施。我国南方棉区土壤普遍缺钾，北方棉区土壤缺钾较少，但近年来北方有些棉田施钾效果明显。在施用氮、磷的基础上，中等地力及中上等地力的棉田每公顷施用氯化钾或硫酸钾135-150千克；中下等地力棉田每公顷施用氯化钾或硫酸钾225千克。
由于棉花的生育期较长，为了保证棉花全生育期对养分的需求，一定要施足基肥。基肥应以有机肥料为主，配施适量性化肥，棉田常用有机肥以厩肥和堆沤肥为主。有机肥的用量与土壤肥力、肥料质量和产量等因素有关。土壤肥沃，肥料优质者少施，反之多施。北方棉田施用有机肥15吨/公顷或绿肥11.25—-22.5吨/公顷，有条件的地方再加施饼肥750—1125千克/公顷。低产棉田，可通过施用化肥促有机肥，达到培肥土壤的目的。一般在施总氮112.5-150千克/公顷的前提下，以纯氮37.5千克/公顷作基肥（其余的75一112.5千克/公顷花铃期作追肥），与有机肥混合撒施后深耕翻，肥效良好。中上等地力的壤质土壤，蓄肥供肥能力强，氮肥以分两次施用为好，即基肥45%，花铃期追肥55%。土壤肥力较差，质地偏砂，保肥能力低的棉田，氮肥可分三次施用，即基肥30%，蕾期追肥20%，花铃期追肥50%。对于新疆内陆棉区和降雨较少以灌溉为主的旱地棉田，为了降低施肥的劳动投入，将化肥全部作基肥施用效果更好。
磷、钾肥作基肥的用量依据土壤中磷和钾含量的高低，同时还需要考虑土壤保蓄肥的能力。保蓄肥能力较强而质地相对赫重的土壤，磷、钾肥可以全部作基肥；保蓄肥能力较弱的砂壤质土或砂质土壤也可留一部分钾肥作追肥。由于棉花为直根系，入土较深，施用基肥时应注意适度深施。磷肥作基肥全层施用或与农家肥混合堆沤后全层撒施为好。一般每公顷施过磷酸钙600—750千克（P20575一105千克）。在基肥用量较少时，为提高磷、钾肥的效果，可在种植行的行下条施。我国南方棉区土壤普遍缺钾，北方棉区土壤缺钾较少，但近年来北方有些棉田施钾效果明显。在施用氮、磷的基础上，中等地力及中上等地力的棉田每公顷施用氯化钾或硫酸钾135-150千克；中下等地力棉田每公顷施用氯化钾或硫酸钾225千克。