内蒙古土壤肥料和节水农业工作站为自治区农牧业厅所属的相当于正处级全额拨款事业单位。内设科级机构五个：综合科、土壤科、肥料科、监测科、节水科。核定事业编制21名。其中：技术人员编制17名，其他人员编制4名。核定处级领导职数3名（1正，2副），科级领导职数8名（4正，4副）。
内蒙古土壤肥料和节水农业工作站的主要职能职责是：承担全区肥料登记备案工作和肥料质量监督检查工作；承担全区土壤资源和宜农土地资源调查、评价工作；承担全区耕地质量与环境评价、定级、监测工作；负责耕地合理使用、节水农业发展规划的组织实施；承担土壤培肥、科学施肥、节水农业新技术的攻关、引进、集成及试验、示范与应用推广工作；承担全区土壤墒情、旱情监测及预报工作。
近几年来，内蒙古土壤肥料和节水农业工作站以国家和自治区重大土肥水项目实施为抓手，在全区开展了测土配方施肥、土壤有机质提升、标准粮田建设、旱作农业示范基地建设、节水农业项目等农技推广工作。在工作过程中，推广机制不断创新、技术模式不断完善、应用规模不断扩大、综合效益不断提升。并通过总结经验、扩大宣传、典型示范、农科教结合、信息技术应用等一系列措施，推动土肥水工作跃上了新台阶。
多年来，经全站职工共同努力，取得了一系列的科研推广成果，其中获自治区科技进步一等奖2项、二等奖2项、三等奖7项；农牧渔业丰收一等奖2项、二等奖2项、三等奖1项；自治区农牧业丰收一、三等奖各1项。
