湖南省种子管理局是省级农作物种子管理机构，负责贯彻国家有关种子的法律法规和方针、政策，制定并组织实施全省种子发展建设规划；负责湖南省种子工程总体规划的制定，种子行业统计和种子工程项目的管理与监督；负责主要农作物品种的审定、引种批复和非主要农作物品种的登记；负责保护和管理种质资源；承担农业植物新品种保护工作；
负责核发主要农作物种子生产许可证、农作物种子经营许可证和监督管理种子生产、经营活动，转基因农作物种子广告审查，进出口种子审核及管理；负责种子质量监督管理，农作物种子质量检验机构的考核，种子生产、经营、检验人员的考核和资格认证；负责国家救灾备荒种子的管理和省级救灾备荒种子的计划编制、管理；负责组织农作物种子质量纠纷田间现场鉴定，调解种子纠纷案件和市场监管工作。
