甘肃省农业科学院前身为甘肃省农业改进所，始建于1938年。中华人民共和国成立后，1952年成立甘肃省农业试验总场，1958年10月成立甘肃省农业科学院。2006年，经省政府批复，确定为省政府直属公益类事业单位，实行省财政一级预算。管理机构设有7个职能处室，另设有纪检委、工会和后勤服务中心。研究机构设有13个专业研究所，在兰外设有3个专业试验站和3个试验场。有国家甲级资质工程咨询中心、国家协会级绿色农业兰州研究中心、省级工程技术研究中心和博士后科研工作站各1个，农业部重点野外科学观测试验站2个。在全省不同生态区设有10个综合试验站和30多个农村试验示范基点。
　 　主要研究领域有：农作物种质资源创新及新品种选育、主要农作物高产优质高效栽培、区域农业（旱作节水、生态环境建设）可持续发展、土壤肥料与节水农业、病虫草害灾变规律及综合控制、农业生物技术、林果花卉、农产品贮藏加工、设施农业、畜草品种改良、绿色农业、无公害农产品检验监测和农业工程咨询设计等。 
　　全院现有职工1811人，在职职工928人，其中专业技术人员666人，高级研究人员191人、中级研究人员213人、初级研究人员262人，博士52人、硕士112人。专家3人、省级专家12人，享受政府特殊津贴专家37人，博士生导师2人、硕士生导师30人，入选国家“百千万人才工程”2人、入选省“333科技人才工程”29人、省“555创新人才工程”31人，省属科研院所学科带头人6人。有3个团队进入省级科技创新团队。 
　　建院以来共取得各类成果830项，其中获奖励成果24项，省部级奖励成果216项，国家专利6项。这些科研成果的示范推广，为解决我省粮食增产、农业增效、农民增收和农村经济发展提供了科技支撑，做出了应有贡献。