番茄腐霉茎基腐病近几年危害比较严重，主要危害刚刚处于缓苗期的番茄，高温高湿容易发病，俗称“茎疫病”，对根系危害不大，但是随着病情发展，会造成死棵。
番茄腐霉茎基腐病主要危害地表上下2至3厘米左右，产生暗褐色病斑，逐渐向上扩展，并绕茎秆一周后，病斑腐烂变褐，变软并且缢缩。
番茄腐霉茎基腐病发病的主要原因是高温、高湿天气的影响，在秋延迟以及越夏种植过程中危害严重，如果缓苗水过大，外界温度30摄氏度以上，会造成该病害大发生。
番茄腐霉茎基腐病防治方法：在番茄定植时可单独使用96%恶霉灵可湿性粉剂3000倍液或70%甲基硫菌灵（甲基硫菌灵）可湿性粉剂1000倍液，也可分别与72%农用链霉素可溶性粉剂2000倍液混合灌根，每株150mL，第6天浇水前再灌第2次，隔7天可灌第3次，防治效果能达到80%以上。或者用恶甲水剂、氟吗。乙磷铝、精甲霜灵锰锌灌根或者喷淋茎基部。