施肥的总原则
1-2年生全草类药材，苗期应多施氮肥，促茎叶生长；种子果实类药材施磷、钾肥；多年生及根和地下茎类药材，整地时要施足有机肥，生长期需追三次肥，次在春季萌发后，第二次在花芽分化期，第三次在花后果前，冬季进入休眠前还要重施越冬肥。合理施肥对增进药用植物生长发育，提高产量和品质，起着重要作用。目前种植药材施肥有两个误区，一是根本不施肥；二是使用大量的化肥。
依据中药材的品种特点施肥
中药材因其品种、以及各生长发育的阶段不同，所需养分的种类、数量以及对养分的吸收强度也不相同。通常对于多年生的，特别是根茎类药用植物，如白芍、大黄、党参、牛膝、牡丹等，以施用腐熟的有机肥为主，配合使用磷钾肥，以满足全部生长周期对养分的需要；对于全草类中药材，可恰当增施氮肥；对于花、果实、种子类的中药材，则应多施磷、钾肥。在中药材不同的生长阶段施肥也不同，生长前期，多施氮肥，使用量要少，浓度要低；生长中期，氮肥的用量和浓度应恰当增长；生长后期，多用磷、钾肥，增进果实早熟、种子丰满。
依据土壤特性施肥
1、沙土：要重施有机肥，如厩肥、堆肥、绿肥、土杂肥等，并掺加黏土，增厚土层，加强其保水肥能力。追肥应少量多次施用，避免一次使用过多而散失。
2、黏土：应多施有机肥，并结合加施沙子、炉灰渣类，以蓬松泥土，增加土壤的透水通气性，并将性肥料做种肥和早期追肥，以利提苗发棵。
3、沙壤土：此类土壤兼有沙土、黏土的优点，是多数中药材栽培理想的土壤，施肥以有机肥和无机肥相结合，依据栽培品种的各生长阶段对肥料的需求合理施用。
依据当地气候条件施肥
在低温、干燥的季节和地区，施用腐熟的有机肥，以提高地力和保墒能力，而且肥料要早施、深施，以发挥肥效。化学氮肥、磷肥和腐熟的有机肥一起做基肥、种肥和追肥施用，有利于幼苗早发，生长茁壮。而在高温、多雨季节的地区，肥料分解快，植物分解能力强，追肥不宜施得过早，而且应量少次多，以减少养分损失。