在药用鱼腥草大面积种植过程中，常见的病害有白绢病和紫斑病，虫害有小地老虎、斜纹夜蛾和红蜘蛛等，应采取下列综合防治措施。
1 农业防治
1.1 选地 选择微酸性沙土或壤土。前茬作物为水生作物，轮作1年或1年以上。若前茬作物为旱生作物，则轮作2年以上。在前茬作物收获后或种植前1个月进行整地，深翻25～30cm，暴晒1周，有利于杀灭病原微生物和减少害虫的发生。
1.2 清园 头茬作物收获后，及时田间杂草和残枝落叶，可减少越冬幼虫和蛹的数量以及破坏病原物越冬场所。同时，在作物出苗前或小地老虎1～2龄幼虫盛发期，及时铲尽田间杂草，减少幼虫早期食料，可消灭部分幼虫和卵。将杂草深埋或运出田外沤肥，可产卵寄主。
1.3 选种和种茎 严格剔除病种茎，选育推广抗病品种。
1.4 加强田间管理 增施有机肥，氮、磷、钾肥配合施用，以增强植株的抗病、虫能力；施用腐熟的农家肥，可以减少虫卵和病原微生物的发生。及时中耕除草。一经发现病株，立即拔除，并挖除带菌的土壤。将病株及土壤带出地外烧毁。挖沟排水，注意雨后排水，防止积水，适当降低湿度，减少发病。高温干旱、空气湿度低应及时、适量浇水，可减少病虫害的发生。
2 物理防治
2.1 人工捕杀 结合田间管理，在苗期，每天清晨到田间扒开新被害苗周围的土壤或被害残留茎叶附近的表土，捕捉小地老虎幼虫，集中处理。在生长后期，人工摘除带有斜纹夜蛾的卵块及低龄群集幼虫的“窗纱状”被害叶，消灭卵和幼虫。
2.2 毒饵诱杀 在苗期，每亩用铡碎的幼嫩、新鲜杂草30kg，与90%晶体敌百虫150g配制成毒饵，于傍晚撒布于地面，诱杀小地老虎幼虫。糖醋毒液诱杀小地老虎和斜纹夜蛾成虫，在春、夏季成虫羽化盛期，用糖∶醋∶白酒∶水＝6∶3∶1∶10加适量敌百虫配置成毒饵于田间诱杀。注意将用过的毒饵及时销毁。
2.3灯光诱杀 小地老虎和斜纹夜蛾对黑光灯都有强烈的趋向性，根据各地实际情况，在可能的条件下，于成虫盛发期每10亩地安装1支20W的黑光灯，在春、夏、秋成虫羽化盛期诱杀成虫。
3 生物防治
3.1 保护和利用天敌 利用本地天敌资源，在天敌发生高峰期不打农药。
3.2 使用生物农药 抑制害虫的发生，用杆状病毒粉300～500倍液喷雾。在白绢病发生初期，每亩（667平方米）用0.4～0.45kg哈茨木霉加50kg细土，混匀后撒覆在病株基部，能有效地控制该病扩展。
4 化学防治
在苗期，主要防治小地老虎；在封行期以后，主要防治白绢病、紫斑病及斜纹夜蛾和红蜘蛛。
4.1 防治指标 在苗期，田间被小地老虎为害株率达10%时进行药剂防治。在封行期以后，白绢病和紫斑病发病率达20%时进行药剂防治。斜纹夜蛾有虫株率达25%时进行药剂防治。红蜘蛛出现2级指标时进行药剂防治。
4.2 施法 喷雾、灌根、土壤处理，根据具体情况而定。
4.3 施药种类 根据防治对象选择相应的农药，合理轮换用药。详见表1。
4.4 用药 按农药操作规程进行，确保人身。
4.5 质量监控 质量监控部门对农药施用过程要进行全程监督，做好监控记录。
4.6 评价与总结 病虫害防治工作结束后，要对防治效果进行评价和书面总结。