沼渣、沼液是很好的肥料，在蔬菜上使用有许多好处，但是在蔬菜生产过程中，往往因使用方法不当，造成秧苗萎蔫甚至死苗，从而影响蔬菜的产量和品质。在生产上科学使用沼渣、沼液要注意以下几条禁忌：
一忌在棚室内的沼气池池顶盖和出料口封闭不严。如果封闭不严，未经脱硫的沼气会把蔬菜叶片烧干。
二忌出池后马上施用。因为沼液、沼渣的还原性较强，如立即施用刚出池的沼肥，它会与作物争夺土壤中的氧气，影响种子发芽和根系发育，导致作物叶片发黄、凋萎。因此，沼肥出池后，应先在储粪池中堆沤5～7天再施用。
三忌不对水直接施用。如不对水直接施在作物上，尤其是用来追施幼苗，会使作物出现灼伤现象。沼液作追肥时，要先对水，一般对水量为沼液的一半。
四忌表土撒施。沼肥施于旱地作物宜采用沟施、穴施，然后盖土，或灌溉时顺水均匀施入田面。
五忌与草木灰、石灰等碱性肥料混施。草木灰、石灰等与沼肥混合会造成氮肥的损失，降低肥效。
六忌过量使用。使用沼肥的量不能太多，一般要比施用普通猪粪肥少，否则，会导致作物徒长而减产。