西红花茎腐病发病部位为茎基部，发现病株要及时喷洒农药进行防治。
发病环境：病菌在病残体内越冬。土壤温度高，湿度大，多雨，土壤黏重，排水不良，地下冲严重，重茬发病重。
防治办法：
1、选择地势高燥，排水良好的沙壤土种植。
2、细心管理，减少根伤。及时防治地下虫，一般采用3%甲基异柳磷颗粒剂每亩3-5kg处理土壤，或90%晶体敌百虫200g加温水适量化开拌粉碎对策饼肥上傍晚撒地表，浅锄混土。
3、发现病株及时铲除，用生石灰撒施病穴消毒，也可用1%敌克松可溶性粉剂药泥封穴，并用72%农用链霉素1000倍液喷洒或用70%敌克松可溶性粉剂600倍液灌注。