据了解发现，农民对番茄灰霉病的防治，长期存在单一用药的习惯，达不到防治目的。只有利用综合防治才能控制灰霉病的发生。
1.种子：用50-55℃温水浸种10～15分钟，要不断的搅拌，使种子受热均匀，然后待水温冷却到28～30℃时，放在25～28℃的恒温处催芽。
2．起垄覆膜定植：起垄定植有利于疏松土壤，促进番茄根系发达，又避免因浇水湿度大而引起沤根死苗。覆地膜有利于保持或提升土壤温度，可隔断因土壤水分蒸发而增大棚室内湿度和膜面结露等不良生态环境。
3.在膜下浇水24小时后，棚室内相对湿度仅达82％～85％，如果满沟浇明水24小时后，棚室内相对湿度高达95％～，不但对灰霉病发生十分有利，对其它喜湿病害也极为有利。
4.生态防治：开花结果期，棚室内白天温度控制22-28℃，夜间10-12℃。相对湿度低于80%时，需15天左右才可产生抱子，其孢子萌发率为0；如果相对湿度在95％以上，灰霉病菌3-4天可大量产孢，48小时孢子萌发率达。由此可见，降湿防病效果非常明显。
5.药剂防治：要抓住番茄灰霉病防治时期，因为开败的花朵是灰霉病菌侵入繁殖的天然培养基，侵害果实引起腐烂。所以要抓住此时机，配合上述的防治措施，再利用、低毒的有效药剂进行防治。首次用药在穗果开花期，结合用防落素喷花，在药液中加入0．1％速克灵等防治灰霉病的药剂，直接对准雌花喷雾，即防止落花落果，又能防治灰霉病的发生；第二次用药是在花败坐果膨大期，为不增加棚室内湿度，应选用防治灰霉病的烟雾剂，在初见发病时，于傍晚封闭好棚室，10延长米放50克（一小包），从外向里放好药包，然后从里向外点燃。1小时后可放风换气，10～15天施放一次。在昼夜通风时，发现灰霉病发生，可用65％甲霉灵600倍液喷雾，7天喷一次，连用2一3次，即可达到防治效果。仅供参考。