对培育幼苗的土壤进行处理，需要按照本地棉花发生病害情况以及防治重点科学选择剂。在播种棉花之前对苗床土壤进行严格的，只有这样才可以的避免病害的发生流行。
通常来说，使用剂对棉花苗床土壤进行处理，主要是为了棉花的炭疽病、猝倒病、立枯病、黄萎病以及枯萎病等病害。经常用于对棉花苗床土壤处理的剂有多菌灵、敌克松、恶菌灵等。五氯硝基苯、福·福锌（含福美双、福美锌）、菌毒清、强氯精、恶霉灵、福美双以及咯菌腈等药剂，能够用来拌种处理以及在棉花苗期喷淋，也可以起到比较好的土壤效果。下面重点给大家介绍以下几种：
棉隆棉隆是为广谱性杀线虫剂，对土壤里的、地下害虫以及杂草也具有兼治功能。该种农药容易在土壤里扩散，对线虫防治效果比较好，并且具有较长的持效期，能够和肥料进行混用，主要表现为熏蒸性。在使用的时候土壤气温应该确保在6摄氏度之上，在12摄氏度到18摄氏度时候为适宜，含水量确保在四十以上。该药对所有绿色植物都有药害，在土壤处理时不可以接触到农作物。
净土灵，该药剂是从微生物代谢产物中提取出来的一种剂，对某些病菌的生长具有抑制功能，比如影响孢子的萌发，致使菌丝形态产生变异，菌丝的孢内生化反应产生变化等。用于对苗床土壤的处理以及苗后的淋喷，能够地防治棉花的黄萎病等许多种病害。该药剂还可以诱导植物产生具有红能的物质，并且能够刺激棉苗等作物的生长。
乙蒜素还可称为剂402，它是一种广谱性的剂。主要用在棉花拌种或是喷淋灌根，对防治棉花立枯病、黄萎病、枯萎病等有着非常好的效果。乙蒜素对农作物生长具有刺激功能，经过其它处理过的种子出苗比较快，棉苗生长较为健壮。
稻脚青主要用在棉苗的炭疽病以及立枯病。主要做好营养钵土以及盖籽土的。笔者建议，通常使用二十可湿性粉剂稻脚青配制成零点三到零点四的药液，把营养土钵给浇湿，并且使用同样浓度的药液对盖籽土进行喷雾。