胡萝卜是半耐寒性蔬菜，温度很高或过低都会对胡萝卜生长不利，胡萝卜若长期水分补充不足，则直根不能膨大，致使胡萝卜的产量明显降低。过于粘重的土壤或者使用未腐熟的基肥，都会妨碍胡萝卜肉质根的正常生长，产生畸形根。
在胡萝卜生长过程中，会遭受虫害的威胁，其危害较大的是菌核病，主要危害胡萝卜的肉质根，危害的部分出现软化腐烂，表面生白色棉絮状菌丝体和黑色鼠粪状菌核。发病初期喷洒40%菌核净可湿性粉剂1000倍稀释液，或50%速克灵可湿性粉剂1500倍稀释液，或50%农利灵可湿性粉剂1500倍稀释液，7-10天喷一次，连续2-3次。主要有胡萝卜微管蚜和茴香凤蝶等。及时用2.5%功夫菊酯乳油、20%灭扫利乳油，或20%氰戊菊酯乳油各3000-4000倍稀释液喷雾防治。