在大豆的生长过程中，各个阶段会发生不同的病虫害，必须根据不同阶段来使用不同的农药来防治：1、大豆出苗前科学施用除草剂
用于大豆出苗前施用的除草剂，常用的有普施特、广灭灵，这两种对禾本科杂草和一些阔叶杂草都能防除。另外，乙草胺和都尔主要防除禾本科杂草，还必须与防除阔叶杂草的豆磺隆或富克混用。施用普施特要注意防止对后茬作物的残留药害。第二年只能种豆科作物。第三年也不能种植甜菜、瓜类。
2、大豆蚜虫的防治(6月中旬-7月上旬，高温干旱时危害严重)
大豆蚜虫多集中在大豆的生长点、顶叶、幼嫩叶背面，刺吸汁液危害。造成叶片卷曲、植株矮化、降低产量，还可传播病毒病，造成减产和品质下降。全年大豆上都可发生。
防治方法：农药药剂防治为主，用522.5g/升氯氰·毒死蜱、或20%甲氰菊酯乳油。
3、大豆食心虫的防治
大豆食心虫是咬食豆粒的小红虫。幼虫钻入豆荚，咬食荚中的嫩豆粒，可吃掉半粒豆，降低大豆产量和品质。此虫一年发生一代，以老幼虫在豆地结茧越冬。第2年7月下旬变成蛹和蛾子，飞到豆荚上产卵，7-8月份降雨量多、土壤湿度大，有利于发生。
防治方法：用甲拌磷颗粒剂拌土，8月10日前后，撒于田间，每4垄撒1垄，或用480g/升毒死蜱乳油、或1.8%阿维菌素乳油、或20%乙酰甲胺磷乳油喷雾。
4、大豆根蛆（根潜蝇）的防治
大豆根蛆又叫大豆根潜蝇。只危害大豆和野生大豆。幼虫咬食大豆幼苗根部，形成蛆道，并排泄粪便，造成根部腐烂、豆株矮小，被害严重的豆苗枯死。此虫一年仅发生一代。以蛹在大豆根皮肿瘤内或土缝内越冬，来年5月中下旬，羽化为成虫，在大豆根处产卵，孵化出幼虫，危害豆苗根部。
防治方法：用药剂拌种预防幼虫，用40%乐果乳油按种子量的0.7%拌种。成虫发生盛期可用1.8%阿维菌素乳油、或480g/升毒死蜱喷雾防治。
5、黑绒金龟子的识别与防治
黑绒金电子俗名瞎撞子、大绒马褂。主要以成虫(金电子)危害大豆幼苗，咬食生长点或咬断幼茎，严重发生时可将幼苗吃光造成缺苗断条，甚至毁地。此虫一年发生一代，以成虫在土中越冬，豆茬地发生的多。4月下旬至5月上旬先在杂草上取食，大豆出苗后，咬食豆苗。此虫夜间潜伏在土中，白天出来危害。午后3-5时取食盛，无风日暖的天气虫量。
防治方法：可用20%甲氰菊酯乳油、或2.5%敌百虫、或2.5%敌杀死、等喷施。
6、大豆霜霉病的防治
大豆霜霉病危害幼苗、叶片和子粒。当片真叶展开后，沿叶脉两侧出现褪绿斑块。成株叶片表面呈圆形或不规则形，边缘不清晰的黄绿色星点，后变褐色，叶背生灰白色霉层。病粒表面黏附灰白色的菌丝层，内含大量的病菌卵孢子。病菌以卵孢子在种子上和病叶里越冬，成为来年初侵染菌源。每年6月中下旬开始发病，7-8月是发病盛期，多雨年份常发病严重。
防治方法：用40%乙磷铝，或25%甲霜灵拌种。田间发病时可用乙磷铝或甲霜灵喷洒。
7、大豆根腐病的防治
该病发生后，很难，应以预防为主。发现病株及时拨出，病株残体，并在病株栽植穴及四周撒生石灰。预防可选用甲基硫菌灵、或根腐灵、或多菌灵、或百菌清、或可杀得、或杀毒矾，以上任何一种农药加氨基酸（大豆健粒饱或三天绿等），加黄腐酸盐，加生根粉喷施。每7天喷1次，连续喷2-3次，交替使用，重点喷洒植株的主茎基部。如用以上药液灌植株根部，效果更佳。