防治这两种病害应要做好苗床和营养土的药剂处理，一般每平方米苗床用40%多菌灵或50%福美双可湿性粉剂15~20克，与苗床土混匀。如苗床内已发现病苗，应及时拔除，并在苗床上撒干草木灰，立即喷药防止蔓延。
一、补苗 直播西瓜如果幼苗出土不齐、缺苗较多时应及时补种。补种用催芽的种子，这样出苗快，苗龄相差不大。如果缺苗发生较晚而且数量不多，可在双苗穴内挖取一苗移栽到缺苗穴内。移栽前先浇透水，待水渗下后用铲子起苗，带土坨要大，以免伤根影响成活。为补苗方便，播种时在行间空地多播一些，补苗之用。补苗时苗龄越小越好。 育苗移栽的瓜田，在西瓜幼苗的移栽过程中，如果营养钵破碎，很容易造成瓜苗死亡。当发现缺苗时，应将剩下的营养钵内健壮的瓜苗补栽上去，使补栽的瓜苗与大田苗龄相近。
二、间苗 直播瓜田每穴播种量较大，易因苗多而造成拥挤、相互遮阴等现象，应及时疏除多余的幼苗、病苗。在第二片真叶展开后进行次间苗，去弱留强，每穴留两株健壮的幼苗。幼苗长出第四片真叶时，进行第二次间苗，即定苗，每穴选留一株生长的幼苗。间苗、定苗时，用剪刀或手指除掉淘汰苗，不可连根拔除，以免伤及选留健苗的根系。
三、中耕松土 在幼苗生长期间，为保持瓜根周围土壤疏松，应进行松土工作，操作时一手护住瓜苗及根茎，一手拿铲子在瓜根四周轻轻拍几下，可防土壤板结对幼苗根茎处的伤害。在黏土地上此项工作显得更为必要。瓜垄的行间可浅耕，中耕时结合锄草，一般中耕2～3次，到瓜蔓铺满畦后不再中耕。
四、水分管理 1.看苗浇水：土壤是否缺水可以根据植株的表现来判断，如苗期可在温度较高、日照较强的中午观察，子叶或幼苗先端的小叶向下并拢，叶色变深时，就是幼苗缺水的象征；而子叶略向下反卷，或幼苗瓜蔓远端向上翘起，则表示水分正常；如叶缘变黄，则表示水分过多。植株长大后，在中午观察时发现叶片萎蔫，然后可恢复，表明叶片缺水，叶片萎蔫的程度及恢复时间的长短，则表明缺水程度的大小，根据以上形态特征决定浇水时间和浇水量。 2.土壤不干不浇水，并且浇水量一次不能过多。 3.苗期应控制浇水，果实膨大期适当增大浇水量。
五、病虫害防治 西瓜苗期病害主要有猝倒病和立枯病。对于这两种病害的防治，应采取以加强苗期栽培管理为主，药剂防治为辅的综合防治措施。当苗床开始零星发生立枯、猝倒病苗时，要立即拔去病株，并在苗床上撒些干草木灰，及时喷洒以下农药：75%百菌清（达科宁）600倍液、58%瑞毒霉（雷多米尔）500倍液、大生600倍液、64%杀毒矾500倍液、80%代森锌600倍液等。以上药剂要交替使用，同时可以加入绿芬威一号1000倍液，以增进营养吸收，培育壮苗，增强抗性。