西红柿的细菌性软腐病从果实转红期开始发病，很少危害青果。主要侵染两部分：茎干和果实。
1、侵染茎干。可以造成茎干腐烂，内部中空变褐，能够造成植株死亡，危害比较严重，经常从摘果、掐叶、整枝的伤口开始入侵。
例如，植株打叉过晚，造成的伤口过大，细菌容易侵染；在阴雨天或者露水未干的时候进行田间操作，细菌容易侵染伤口。
2、侵染果实。如果果实施肥或者其他管理不科学，造成果实皴皮、裂果，细菌容易侵染，导致果实内部水烂，有臭味，但是果皮保持良好。
一般在夏秋湿度大时发病严重，露天西红柿发病重于温室栽培。
防治方法：
1、尽量减少果实以及茎干伤口，防止细菌侵染。在果实膨果盛期，可以叶面喷施硼钙叶面肥，防止果实裂果或者皴皮。
2、叶面喷施细菌药剂，例如中生菌素、叶枯唑、喹啉铜等药剂。
3、及时将病原体（病果、枝叶）清处棚外，因为细菌可以在土壤中残留，随着灌溉水等传播。