这些年来，我国大棚蔬菜的发展速度十分迅速，其栽培面积大幅度扩大，但是由于大棚的环境与露天有所不同，所以其病虫害的发生那个也较为频繁，想要生产出优质的蔬菜，科学正确的防治大棚蔬菜病虫害就尤为关键。
由于大棚蔬菜所生长的环境中，其日光、温度、湿度、等各方面条件都是其它种植环境与众不同，而对应的其病虫害的发生条件和生存条件同样有所改变，所以对大棚蔬菜病虫害的防治要做到一下几个方面：
首先要正确选药，轮换用药。因为每种农药都有其特定的防治对象和防治范围，所以在用药前要充分了解大棚蔬菜病虫害的发生情况和环境条件，正确选择其对应的农药，又因为单一用药会促使其产生抗性，所以要尽可能的选用作用机制不同的农药进行轮换用药。
比如杀虫剂的有机磷制剂、拟除虫菊酯类制剂、氨基甲酸酯制剂、有机氮制剂、生物制剂、昆虫生长调节剂、除草剂等其作用机制各有不同。如果菜蚜对乐果产生抗药性，就不能在使用敌敌畏，因为菜蚜也会对敌敌畏产生抗药性，但可以选用吡虫啉类。蔬菜一产生抗性的苯并咪唑类杀菌剂（多菌灵、托布津等）、类杀菌剂等内吸杀菌剂，可以同不一产生抗性的代森类、无机硫制剂类、铜制剂类等接触性杀菌剂轮换使用。
其次，适时用药。由于大棚内环境条件的会影响到药效，所以要在合适的时期用药，不能再高温下使用硫制剂防治瓜类及蔬菜病害；而在冬季利用烟雾剂防治大棚蔬菜病虫害，利用农药气化后冷凝成烟雾颗粒或直接把农药分散成姻雾粒防治病虫害，有着不错的效果。
再次，混合用药。同样是针对大棚蔬菜抗药性，如果大棚蔬菜病虫产生了抗性，那么混用农药将会成为十分有效的手段，如瑞毒霉和代森锰锌混用、有机磷剂与菊酯类混用，杀螨剂与其它杀虫剂混用，杀虫剂与杀菌剂混用。但是在大范围使用混合药剂前一定要进行小范围的实验，而且，同样不能长期使用，否则也会产生抗药性。
，合理正确用药。在蔬菜生产中应选用高效、低毒、低残留的生物农药品种，有机类的的菊酯类、部分中、低毒性的有机磷、有机硫等杀虫剂、杀菌剂及部分中低毒性的二苯醚类除草剂等等。如：氯氰菊酯、溴氰菊酯、乐果、敌敌畏、辛硫磷、多菌灵、百菌清、甲霜灵、粉锈宁、扑海因、甲硫菌灵、抗蚜威、禾草灵、稀杀得、禾草克、果尔、都尔等。而高残留的有机氯类农药、二次中毒的氟乙酰胺、代谢物为“三致”物的乙撑硫脲等诸类农药一定要避免使用。无机类的硫制剂、铜制剂、磷化物，如硫酸铜、波尔多液、石硫合剂、磷化锌等。同时生物源农药也是十分不错的选择，其包括植物源农药、动物源农药和微生物源农药。如：BT、除虫菊素、烟碱大蒜素、性信息素、井岗霉素、农抗120、浏阳霉素、链霉素、多氧霉素、阿维菌素、芸苔素内脂、除螨素、生物碱等。