油菜黑腐病会在油菜幼苗和成株期均会发病。油菜叶脉间出现黑褐色，油菜的叶柄出现暗绿色水渍状，有时还会出现黄色菌脓，油菜黑腐病的病斑扩展致油菜叶片直至油菜干枯。
油菜在抽薹后主轴上产生暗绿色水浸状长条斑，在油菜湿度大时，溢出大量黄色菌脓，随后油菜黑腐病渐渐变黑褐色导致油菜腐烂，油菜的角果感染油菜黑腐病出现干秕或枯死。
油菜黑腐病的病菌在种子上或遗留在土壤中的病残体内及采种株上进行越冬。油菜幼苗出土时依附在子叶上的病菌从子叶边缘的水孔或伤口侵入，引起油菜引发油菜黑腐病病害的发生。油菜黑腐病的细菌由果柄处维管束侵入，进入种子皮层或经荚皮的维管束进入种脐，致种内带菌，会随着病菌进行远距离的传播。
为了及时的防治油菜黑腐病，应采取有效的方式进行防治油菜黑腐病。农业人员应及时选用优质、抗病种的油菜品种进行播种；同时，选用好油菜品种后，及时对种子进行消毒，100ml水中加入0.6ml醋酸、2.9ml硫酸锌溶解后温度控制在39℃，浸种20分钟，冲洗3分钟后晾干播种，也可用45%代森铵水剂300倍液浸种15-20分钟，冲洗后晾干播种；或用50%琥胶肥酸铜可湿性粉剂按种子重量的0.4%拌种可预防苗期黑腐病的发生。
同时，还可选用农抗751杀菌剂100倍液15ml浸拌2009种子，吸附后阴干；可以有效的防治油菜黑腐病。农业人员应加强油菜间的管理，在油菜黑腐病发病初期，及时选用药剂开始喷洒72%农用硫酸链霉素可溶性粉剂3500倍液或新植霉素100-200mg/kg、氯霉素50-100mg/kg、14%络氨铜水剂350倍液、12%绿乳铜乳油600倍液，可以及时的控制油菜黑腐病，效果极为显著。