在不同的时期防治马铃薯晚疫病要有不同的方法，马铃薯晚疫病总体防控策略，要实施以推广抗病品种和脱毒种薯为基础，种薯处理、健身栽培和预测预报指导下，药剂防控相结合的综合防控措施，大力推进专业化统防统治，及时有效控制病害流行。
播期防治
推广抗病脱毒种薯，播种前淘汰病烂薯，提倡小种薯播种，需切块时，切刀用酒精、高锰酸钾或福尔马林浸泡消毒；种块可选用恶霜锰锌或霜脲·锰锌等药剂拌种，旱作区可用马铃薯专用浸种剂加上述两种药剂混合拌种，种薯拌药后避光晾干播种。避免与茄科类、十字花科类作物轮作或套种，禁止与番茄轮作。
生长期防治
1.加强监测预警。采取系统监测与田间实查相结合，定点调查与大田普查相结合，确定防治时期。
2.中心病株处理。当发现中心病株时，要连根及薯块全部挖出，带出田外深埋（深度1米以上）或销毁，对病株周围50米范围内喷施霜脲·锰锌或氟吡菌胺·霜霉威等药剂进行封锁控制，隔7天喷1次，连喷3次，阻止病害扩展。
3.控制徒长。在现蕾期当株高30-40厘米，且有徒长迹象时，采用烯效唑或马铃薯专用植物生长调节剂均匀喷雾控制徒长。
4.药剂控病。从现蕾期始喷施1~2次保护性杀菌剂，如代森锰锌、氰霜唑、丙森锌、双炔酰菌胺等进行预防；田间见病后，重发区应立即组织开展专业化统防统治，选用性杀菌剂，如烯酰吗啉、氟吡菌胺·霜霉威、恶唑菌酮·霜脲氰、霜脲·锰锌等药剂喷雾防治2~4次，常发和偶发区根据监测预报选用上述药剂防治2~3次或用申嗪霉素、枯草芽孢杆菌等生物制剂防治。均匀周到喷药，喷药后4小时遇雨应及时补喷。注重轮换用药，适当利用有机硅助剂提高药效。
5.收获前预防块茎感病。马铃薯收获前一周进行杀秧，把茎叶清理出田外集中处理。杀秧后地表喷施一次霜脲·锰锌或嘧菌酯预防块茎感病，选择晴天收获。
贮藏期管理
入窖前剔除病薯和有伤口薯块，在阴凉通风处堆放3天。贮藏前用硫黄、腐霉利·百菌清或三氯异氰脲酸熏蒸消毒贮窖。贮存量控制在贮窖容量的2/3以内。贮藏期间加强通风，温度控制在1-4℃范围，湿度不高于75%。
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