一、早疫病
发病后叶面具同心轮纹状病斑，暗褐色，水渍状。茎和叶柄、果实等发病后也有同心轮纹病斑，潮湿时病斑上有黑色霉状物。
防治方法：发病前或发病初期喷施70%代森锰锌可湿性粉剂500倍液、75%百菌清可湿性粉剂600倍液、64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液、72.2%普力克水剂1000倍液，每7天1次，连喷3~4次。
二、叶霉病
果实发病时蒂部周围有凹陷较硬的黑色病斑，叶片有不规则黄色病斑，潮湿时产生褐色霉层，使叶片枯黄、卷曲，然后脱落。
防治方法：发病前后可用70%代森锰锌可湿性粉剂500倍液，每7天1次，连喷3~4次。
三、晚疫病
晚疫病是番茄的毁灭性病害，具有起病急、蔓延流行迅速的特点，一旦发病，若不及时合理防治，短时间内即可扩展至全棚导致拉秧。
受害叶柄和主茎呈黑褐色腐烂，幼苗萎蔫倒伏，病斑从叶尖叶缘开始，潮湿时有白色霉状物，干燥时干枯，病斑由褐色转暗褐色，水渍状或云纹状，稍凹陷，病果坚硬。
防治方法：发病时可用欧福莱喷雾防治，每7天1次。
四、灰霉病
苗期受害可造成茎叶腐烂，呈污绿色至灰褐色，表面密生灰霉。成株期叶片发病，一般从叶尖呈V型向内扩展，病斑扩展不受叶脉限制，潮湿时发展较快，上生灰绿色霉层。
茎部发病多由病叶叶柄扩展所致，花受害时花瓣及柱头腐烂脱落，受害的柱头常使幼果果脐染病。果实受害多始于果脐或果蒂，青果受害多。
果面上出现水浸状褪色斑，渐扩大致全果腐烂，病部表面密生灰褐色霉层。
防治方法：定植前，用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液喷淋幼苗，防止带菌入棚。喷花时在药液中加入防灰霉病药剂，提早预防。
五、病毒病
在田间症状主要有6种，其中以花叶、蕨叶、条斑三种为常见。
花叶型：叶片上出现黄绿相间或深浅相间斑驳，叶脉透明，叶略有皱缩，病株比健株矮。蕨叶型：植株不同程度矮化，由上部叶片开始全部或部分变成丝状，中、下部叶片向上微卷，花冠加长增大，形成巨花。
条斑型：可发生在叶、茎、果上，病斑因发生部位不同而不同。在叶片上为茶褐色病斑或云纹。在茎蔓上为黑褐色斑块，变色部分仅处在表层组织，不深入茎、果内部。
防治方法：
1、杀虫防病。重点防治蚜虫、烟粉虱，切断传播途径。可用10%吡虫啉1500倍液或20%啶虫脒乳油2000倍液或1.8%阿维菌素乳油1500倍液喷雾防治；在烟粉虱若虫期，用25%噻嗪酮可湿性粉剂1000~1500倍液防治效果较好。
2、在发病初期，可用2%宁南霉素水剂500倍液，或病毒A500倍液喷雾，可有效抑制和减缓病毒病发生。
六、青枯病
秋番茄易得青枯病，一般从大量开花结果时开始发病。初发病时，叶片、嫩茎白天萎蔫，傍晚恢复正常，反复多日后，萎蔫症状加剧，整株呈青枯状枯死，横切病茎可流出白色菌液。
防治方法：发病初期用72%农用链霉素可溶性粉剂4000倍液，每株灌0.3-0.5升，8-10天灌一次，连灌2-3次，防治效果较好。