芹菜细菌性软腐病主要危害叶柄基部。防治方法：
田间管理。芹菜软腐病主要通过土壤等传播，重茬地的土壤易积累大量病菌，连茬种植势必易发病和加重病情，所以应实行两年以上的轮作。由于芹菜软腐病菌首先是从植株的伤口处侵入，在定植、中耕、除草等各种操作过程中，应避免伤根或使植株造成伤口。定植不宜过深，培土不应过高，以免叶柄埋入土中。雨后及时排水。发现病株及时清理，并撒入石灰等消毒。发病期减少或停止浇水，防止大水漫灌。
及时防虫。昆虫能在植株上造成伤口导致发病，所以应及时防虫。
清洁田园。田间出现病株后立即拔除，并用药液及时处理，浇灌病株及其周围健株，可减轻发病。收获后及时清理病株残体，并携出田外深埋或烧毁，深翻土壤，加速病残体的腐烂分解。
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