水稻绵腐病是为常见的一种真菌性病害，尤其是在水稻秧苗期发生多。尤其是在低温环境的条件下，发病极为严重。水稻在播种后，若气温低于10℃以下的温度，秧苗的根部活力就逐渐减退，其吸水吸肥的能力随之下降，终导致烂秧。
水稻秧苗在3叶期前后，气温逐渐下降，持续的时间越久，根部的生长明显缓慢，病菌随之侵染秧苗，烂秧就越发严重。水稻绵腐病在发病时，秧苗的幼芽部位出现少量的乳白色胶状物，随后会随之逐渐扩散，致使整株出现铁锈色，受到侵染的水稻内部出现腐烂，导致不能萌发，病株由基部腐烂而渐渐枯死。在发病期间，受到低温的影响，水稻生育提供了病菌侵染的条件，播种后气温越低，持续的时间越长，对水稻产生的生育影响越大，水稻绵腐病就越来越严重。
采取有效的措施及时防治水稻绵腐病，将严格的挑选种子，防治水稻芽儿受冻，催芽时防治过热，不得超过30℃，催芽过后应及时晾种；加强水稻间的水分管理，湿润育秧播种后，遇低温下雨天短时，应灌水保护其水稻发芽。可以采用药剂进行防治，在播种前采用敌克松对苗床进行消毒，一旦发现病株后，及时施用药剂进行防治。每亩采用25%甲霜灵可湿性粉剂800倍液-1000倍液或65%敌克松可湿性粉剂700倍液或硫酸铜1000倍液均匀喷施。
水稻绵腐病在发生病害严重时，秧田应更换清水2-3次后在进行施药。另外，每亩撒施草木灰15公斤-25公斤，会有一定的防治效果。