苹果苗防烂根应及时的加强园林间的管理，杂草及落叶，可以有效的防止病害的发生。
苹果苗防烂根加强栽培管理，果园要及时进行排灌，防止旱涝。增施有机肥料、改良土壤，提高土壤肥力并适当增施钾肥。以增强苹果树势，提高树体抗病能力。在发现苹果苗烂根病株后，应根据不同病害进行处理。先对周围的土壤进行药剂，可以有效的防治。苹果树烂根，及时刮除苹果病变的组织，并及时带离果园区域，并将其销毁。选用药剂70%五氯硝基苯，以1：50-100的比例与新土混合均匀，分撒到病根周围；每株小树用药量为50-100克，大树为150-300克；用50%代森铵水剂500倍液或50%退菌特可湿性粉剂250-300倍液、硫酸铜100倍液、40%甲醛l00倍液等浇灌土壤，也有一定的防治烂根的效果。
农业人员加强园林间的管理，定植后抗病性强的砧木，选用优质、抗病的品种，进行播种。苹果植株种植于地势高、土壤肥沃、保水保肥的生长环境中，更有利于苹果植株的生长发育，能提高其产量和品质。对苹果坑土进行，选用药剂500倍液硫酸铜、75%五氯硝基苯800倍液、50%代森铵400倍液、40%福美砷500倍、70%甲基硫菌灵可湿性粉剂1500倍液、2%农抗120水剂200倍液，正确施用，效果极为显著，可以有效的防止苹果苗烂根的现象。