苹果树的不合理施用化肥不仅会降低苹果品质、影响苹果价格，还会促使发生黄叶、缩果、腐烂等病害问题。苹果施肥的不合理主要体现在以下几点：
1、氮肥施用量过大：浪费严重且会引发其它问题：一是加重病害发生，如腐烂病；二是使果实着色差，耐贮性、口味、品质下降；三是降低钙元素的吸收；四是影响硼元素的吸收，导致缩果病产生；五是阻碍花芽分化，使产量降低。
2、磷肥施用量过大：含磷过高，与铁形成磷酸铁不溶于水，不能再吸收利用，导致果树缺铁，出现黄叶病。还可以与锌形成磷酸锌，不能再吸收利用，导致缺锌，形成小叶病。
3、有机肥施用太少和未腐熟：一般情况下，有机肥应达到“斤果斤肥”，高产果园施肥量更高。有机肥如果不经过腐熟直接施入土壤，各种土传病害会随之进入果园引发或者加重某些病害；另外会出现烧根现象。
4、钾肥施用不平衡：土壤缺钾影响果树对氮的吸收，产生黄叶，终导致产量降低；另外，造成土壤缺镁，也会导致产生黄叶。
5、施肥时间不合理：大部分果农春季施肥，而秋季不施肥。实验数据证明，秋季施肥可帮助恢复树势，有利于根系吸收，为来年开花结果储备大量营养，来年获得高产；能提高抗寒能力，降低冻害产生；会损害部分根系，起到修剪作用。
二、施肥过程中应留意的技术问题
1、施肥时间
苹果生长对肥料有两个吸收高峰期：从春天开花到坐果是个吸收高峰期，果实膨大期是第二个高峰期。个高峰期氮的吸收量比第二个多，而钾在第二个高峰期吸收更多，磷肥吸收量全年基本平稳。
花前肥：主要作用是促进开花坐果和果树营养生长的需要。一般在3月的中下旬施用，每株施用高氮复合肥0.5-1.0公斤。
壮果肥：以氮、钾为主，配合磷肥，多在6-7月份进行。壮果肥可一次性施入，这样既可花芽形成，又可果实的膨大。选用高钾复合肥每株1.0-1.5公斤，配合施用适量的微肥。
秋施基肥：多在10月中上旬采果以后进行，主要是促进树体复壮，贮存足够营养，明年花芽分化。基肥主要以有机肥为主，按“斤果斤肥”施用较好，每株配合施用三元复合肥1.5-2公斤。
另外，小树施肥以氮、磷肥为主，钾肥减半；结果期应控制氮的使用量，增加磷肥的施入量；盛果树应氮、磷、钾配合施用；衰老树增加氮肥用量，重点是秋季施肥。弱树，基肥增加树势，花前肥促进新稍生长，适当增加氮肥用量；旺长树枝干茂盛，结果很少，基肥施用应后移，在落叶前施，花前肥在新稍停止生长时施用；结果过多的树，花芽分化期增施一次肥料，秋季施肥增加磷、钾肥用量；结果少的树，重点施秋肥；高产、稳产果树，三个时期氮磷钾肥配合施用。
2、施肥方法
环状沟施：特别适用于幼树施基肥，在树冠外沿20-30厘米处挖宽40-50厘米、深50-60厘米的环状沟。随树冠扩大，环状沟逐年向外扩展。
条状沟施：在树的行间或株间或隔行开沟施肥，沟宽40-50厘米、深50-60厘米。此法适于密植园。
穴施：根据施肥量的多少，在树冠外围挖穴1-4个，深50-60厘米、长80-100厘米、宽40-60厘米。