随着我国畜牧业的快速发展，一些潜在的问题也随即而出畜牧业问题是其一。另一种就是畜牧业造成环境污染的问题，造成这一问题的主要原因之一就是畜禽粪便乱排乱放。解决畜禽粪便造成的环 境的问题现在可以依靠科学技术把畜禽粪便集中处理制成肥料，应用到农业上。
现代农业上对畜禽粪便的处理方法一般为：自然堆积、太阳能大棚发酵法、高温快速干燥法。
这三种方法各有各的好处自然堆积就是把畜禽粪便直接放到阳光充足的空地上面，使畜禽粪便自然发酵。这种方法的弊端就是发酵时间长，占用的空地面积太大，如果遇到阴雨天气将会对环境造成非常 大的污染，这种方法只是用以个别地区。太阳能大棚发酵法听名字我们就可以明白这种方法就是把畜禽粪便放到塑料大棚里面，通过人工调制、以及利用太阳能加快畜禽粪便的发酵。这种方法相对来说 较好，成本低、投资少，污染小，缺点就是其需要的时间相对来说还是太长。高温快速干燥法是一种通过科学技术实现的一种畜禽粪便处理方法，这种方法的好处就是用时少、干燥快、生产率高、而且 还可以杀死畜禽粪便中的有害菌种。
除此之外我们还可以把畜禽粪便综合的处理。不仅可以达到畜禽粪便的废弃物减少和畜禽粪便肥料化还可以使畜禽粪便资源充分的利用。我们综合处理畜禽粪便方法有好氧堆肥、厌氧发酵与好氧发 酵等。
这些方法可以使畜禽粪便的得到有效的利用，提高了经济效益，还解决了畜禽粪便带来的环境污染问题，是一举多得的好事。